これはキャリア(ドコモ、au、ソフトバンク等の通信事業者)が新規ユーザーの獲得を優先しているためです。
新規ユーザを獲得すると、契約数に相応した金額が報奨金としてキャリアから販売代理店に支払われています。
このため、機種変更価格が5万円以上するものが新規契約で0円といった価格で販売することができるのです。
この奨励金は既存ユーザーの利用料金から出されるものなので、ある意味長期利用ユーザーを冷遇している制度ともいえます。
特にMNPではそれが顕著で、端末がタダのうえに更にキャッシュバックまでついてくることもあるくらいです。